来自**中文大学的研究人员通过大规模平行测序技术(massively parallel sequencing),发现肝细胞癌(hepatocellular carcinoma)患者血浆中存在异常伸长和缩短的dna分子。这项研究发布在了2月2日的《美国国家科学院院刊》(pnas)上。
领导这一研究的是**中文大学的卢煜明(y. m. dennis lo)教授。卢煜明教授是分子生物学的临床应用专家,尤其致力于人体内血浆dna和rna的研究。卢教授早在1997年就发现了孕妇外周血中存在漂流的胎儿dna,并发展出了一套新技术来准确分析和度量母亲血浆内的胎儿dna,被誉为无创产前诊断的奠基人。2013年入选美国科学院外籍院士。
原发性肝癌是临床上常见的消化系统恶性肿瘤之一,其中90%为肝细胞癌,在世界范围内发病率呈现上升趋势。肝癌起病隐袭,早期诊断困难,大多数患者确诊时已中晚期,且约90%的患者被诊断为肝癌时已是中晚期,而丧失手术机会。
目前临床上常用的肝癌诊断标记物为甲胎蛋白,简称afp。然而,afp诊断肝癌的敏感度和特异度并不十分理想。在妊娠妇女、急慢性肝炎、生殖腺肿瘤和胃肠道肿瘤等人群中afp亦可能升高。约40%的肝癌患者afp并不升高,呈afp阴性。因此,找到特异性和敏感性的肝癌诊断新方法迫在眉睫。
1948年科学家们首次发现人体血液中存在着循环dna,癌症患者的循环dna则发现于1977年。在那之后又过了17年,人们才发现这些dna含有癌症的标志性突变,说明它们来自于肿瘤。当癌细胞破裂和死亡之时,会释放出循环肿瘤dna(ctdna)等内容物,这些ctdna基因组片段漂浮在血液之中。
分析ctdna为通过液体活检标本来实现实体瘤评估开启了新的可能性。尽管人们日益认识到它的临床潜力,但对于这些ctdna许多方面的生物特性却仍不是很清楚。就这些血浆dna分子的大小而言,许多研究报道称发现了延长的肿瘤源性血浆dna,而另一些研究的证据则表明肿瘤释放出了缩短的血浆dna分子。
在这篇新文章中,作者们报告称对90名肝癌患者、67名慢性乙肝患者、36名乙肝相关肝硬化患者以及32名健康对照人群的血浆dna大小情况进行了详细的分析。他们采用大规模平行测序以单碱基分辨率,在全基因组水平上测量了血浆dna的大小。研究人员通过染色体臂水平z-score分析(caza)进一步鉴别了这些肿瘤源性的血浆分子,以检测它们的特异性大小情况。
他们证实在肝癌患者的血浆中存在着数组异常长和短的dna分子。这些短dna倾向于携带着一些肿瘤相关的拷贝数异常。研究人员进一步证实在肝癌患者的血浆中线粒体dna的量增高。这些分子比血浆中的核dna要短得多。
这些新研究结果增进了人们对于肿瘤源性循环dna大小情况的认识,并有可能进一步提高人们利用血浆dna来作为分子诊断工具的能力。
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